昆明市口腔医院成立于1991年，是昆明市卫生健康委员会直属单位，随着业务扩大，于2016年成立昆明市口腔医院北市区分院。作为昆明市医保定点单位，医院承担了北市区社区居民服务的医疗工作，同时还承担了昆明市五华区的儿童口腔干预项目，并为2019年被评该项目技术指导医院，今年被评为该项目的先进集体。