医院建于1953年， 2005年增挂“自贡市妇女儿童医院”牌子，2015年和自贡市计划生育指导所整合，增挂“自贡市妇幼保健计划生育服务中心”牌子。迄今已有65年的历史。
医院被授予爱婴医院、自贡市生殖医学研究所、四川省省级首批儿童早期综合发展示范基地、中国出生缺陷干预救助基地、全球超声无创治疗良恶性肿瘤技术产业化临床示范基地、全国妇幼保健机构中医药工作示范单位、全国药物临床试验机构。

四川省新生儿疾病筛查自贡分中心、新生儿窒息复苏培训中心、四川省产前诊断中心自贡分中心、四川省新生儿遗传代谢疾病筛查自贡分中心、四川省开展人类辅助生殖技术服务规划单位。

重庆医科大学附属儿童医院网络指导医院、四川大学华西医院/华西第二医院网络联盟医院、成都中医药大学非直属附属医院、西部儿科发展联盟理事单位、西部儿童孤独症康复联盟成员单位。

四川省住院医师规范化培训妇产科独立基地、儿科独立基地、四川省护士规范化联合培训基地。

自贡市妇产科质量控制中心、自贡市妇幼健康临床检验与病理质量控制中心、自贡市产科急救指挥调度中
2008年建成“三甲”保健院；2014年通过三甲复评。规划占地20.3亩，建筑面积约4.35万㎡，业务用房2.99万㎡。目前有院本部、生殖医学研究所两部分。编制床位510张，目前开放310张（其中中西医结合科18张，妇科84张，产科103张，儿科55张，新生儿科50张）。截止2018年11月30日，全院在岗职工633人，高级职称81人，博士、硕士研究生23人，硕士导师1人，四川省名医1人。全院科室37个，其中职能科室18个、业务科室19个。

有省级重点专科1个（妇产科,甲级）；市级重点专科3个（儿童保健科、新生儿科、生殖健康与不孕科）。
2017年，医院年门急诊43万人次；年出院近1.7万人次；接产近6000人次；住院手术5000余台次；产前诊断近2.2万人次；儿童保健近10万人次。
医院综合实力位居全省妇幼计生系统第二，全国325所地市级妇幼保健院排名56位，其影响力辐射川南、云南和贵州等周边省份。获得“全国妇幼健康服务先进集体”“全国巾帼建功先进集体”；“省级文明单位”“四川省巾帼文明岗”“对口帮扶工作表现突出单位”“实施全面两孩政策表现突出单位”“0-6岁残疾儿童筛查工作成绩突出先进单位”；“自贡市十二五计划生育工作先进集体”“公共卫生先进集体”“市级最佳文明单位”“先进基层党组织”等各级各类表彰。