医院始建于1956年，坐落于著名的旅游胜地海南省保亭黎族苗族自治县，紧邻三亚市（70公里），地处北纬18°以南，属热带季风气候区，气候温和，雨量充沛，这里“温而不热、凉而不寒、爽而不燥、润而不潮”。
保亭县得天独厚的地理位置、适宜的气候和丰富的自然资源、旅游资源，成为人民休闲、疗养、旅游、独家的最佳去处。医院占地面积80000㎡，总建筑面积29300㎡，现设有内科、外科、妇科、产科、儿科、急诊科等临床科室20个；检验科、放射科、超声科等医技科室10个；行政职能科室10个；实际开放病床240张，在职职工310人，高级职称31名，中级职称44名。医院拥有先进医疗仪器设备；如GE牌16排螺旋CT、飞利浦彩色超声、DR、奥林巴斯全自动生化分析仪、奥林巴斯电子胃镜、腹腔镜等。是一所集医疗、教学、科研、预防、保健和急救为一体的二级甲等综合医院。
2018年10月31日上午，海南省第三人民医院正式托管保亭县人民医院，省第三人民医院是国家三级甲等公立医院，拥有科学的管理模式、先进的医疗技术、优秀的专业人才。海南省第三人民医院作为琼南首家三甲医院，在医疗救治、医疗保障、医学人才培养等方面处于琼南地区领先水平，以此全面托管为契机，将给予保亭县人民医院全方位的支持，帮助进一步规范管理，加强医疗质量管理和学科建设，打造专科特色，提升服务质量，逐步打造形成打三亚急救圈，为当地老百姓提供更加安全、优质、高效、便捷的医疗健康服务。