南京市中心医院（南京市市级机关医院）成立于1949年，是南京市首任市长、开国元帅刘伯承为机关干部保健而创建的医疗所，原名南京地区公费医疗第三门诊部、南京市市级机关门诊部、南京市市级机关医院；2015年3月更名为南京市中心医院（南京市市级机关医院），是集医疗、保健、教学、科研为一体的二级甲等综合医院，面向社会提供医疗服务。历年来，病员综合满意度平均达到98%，医院每年收到患者的表扬信百余封、锦旗和牌匾数十面，先后荣获省、市“文明单位”“节能示范单位”“精神文明建设先进单位”“模范职工之家”“巾帼文明示范岗”“青年文明号”“医保诚信单位”“优秀基层党组织”等光荣称号。
医院位于成贤街116号，总建筑面积近3.5万平方米，现有职工486人，高级技术职称73人，中级技术职称113人。目前开设床位300张，年门诊量约45万人次，日均各类手术20余台。医院成立了鼓楼医院消化科分中心、老年病防治研究中心、糖尿病防治研究中心、骨科中心、心血管病医院分中心等7个中心，是东南大学医学院教学医院、东南大学附属中大医院合作医院、南京医科大学康达学院教学医院、南京中医药大学国际针灸培训基地。老年科、内分泌科、心血管内科、神经内科、普外科、骨科、重症医学科、医学检验科、放射科为南京市医学重点专科。
医院科室设置齐全，设备设施先进，流程合理便捷，环境舒适温馨。现有临床科室23个，医技科室11个，开设10个病区，包括内科（心血管内科、内分泌科、神经内科、消化内科、呼吸内科、肾脏内科）、老年科（干部病房）、重症医学科（ICU）、普外科、骨科中心、妇科等。另设有急诊科、门诊部（口腔科、眼科、耳鼻喉科、中医科、皮肤科、儿科）、康复科、血液净化中心、体检中心及多科专家专科门诊。
医院拥有核磁共振成像系统、全身螺旋CT（128层）、数字化X线成像系统（DR7500、DRX-1、DRX500、DigitalDiagnost C50）、数字胃肠机、乳腺钼靶机、X线骨密度仪、C型臂X光机、全自动生化仪（7180、COBAS C702）、化学发光仪、彩色超声诊断仪（HD-11、IU-22、IE33、EPIQ5、CX30）、彩色经颅多普勒系统、运动心电测试系统、24小时动态心电及动态血压检测仪、蓝激光胃镜、电子胃镜、肠镜、宫腔镜系统、腹腔镜系统、超声刀系统等大型医疗设备五百余台，并系统配置了计算机网络管理系统（HIS、LIS、PACS、EMR）、中央空调、中心供氧、中心正负压、中央监护等设施，为医院现代化发展定位奠定厚实的基础。
在长期的临床诊疗和科研教学工作中，医院逐步形成了以老年医学为特色和优势的医疗格局，对老年疾病特别是老年慢性病的治疗和康复积累了丰富经验。医院明确发展思路，提出到2020年要实现：将医院建设成为三级老年病医院的目标，我们将以《江苏省老年病医院基本标准》《等级医院评审》为标准，加强流程再造、加大信息化投入，改善机关干部和群众的就医感受，使医院管理、医疗技术、服务质量和硬件设施设备等全面与三级医院功能和任务相适应，为实现三级老年病医院而不懈努力。